Visualisation des filaments d'actine et de myosine

Il s'agit de comprendre le rôle de la myosine dans la contraction musculaire.

QUESTION 1

Vous allez utiliser l'application de visualisation de modèles moléculaires en ligne Libmol pour identifier l'organisation des molécules de myosine et d'actine dans un sarcomère. On attend un schéma légendé (peut être fait à la main) ou une capture d'écran légendée. A rendre dans le casier numérique de Delphine SECHET Enseignant sur l'ENT. Ce schéma et le suivant peuvent être rendus sur le même document. Pensez à mettre votre nom.

Manipulations à effectuer :

Rechercher le fichier Myosines et filaments d'actines en complexe (taper les 1ers mots dans Fichiers - Rechercher - puis sélectionner le fichier). Le fichier est très gros il met du temps à se charger.

Les différentes chaînes moléculaires présentes apparaissent en bas de page (chaîne doit être en bleu pour la commande "Colorer") :

Passer dans l'onglet "Commandes"

Dans le champ "Sélectionner", taper :A :D :P :G

puis cliquer sur la coche

Résultat obtenu

Dans la partie "Représenter" cocher :

Fermer la sélection précédente :

Passer dans l'onglet "Commandes"

Dans le champ "Sélectionner", taper :0 :1 :2 :3 :4 :5 :6 :7 :8 :9 :V :W :X :Y :Z

puis cliquer sur la coche

Dans la partie "Représenter" cocher :

En passant la souris sur les différents éléments vous pouvez identifier les myofilaments d'actine et de myosine. Vous pouvez également manipuler la molécule pour la disposer dans l'espace de manière à bien identifier les différents éléments.

QUESTION 2

Comparer deux états d'un filament de myosine au cours de la contraction musculaire. On attend un schéma comparatif légendé et titré montrant les modifications de la molécule lorsqu'elle est liée ou non à l'actine.

Vous allez utiliser une interface de visualisation multiple libmol choisissez ce qui est le plus stable sur votre tablette, téléphone ou ordinateur :

Accéder à l'interface pour comparer 2 molécules : lien

Interface pour comparer de 2 à 4 molécules avec Libmol : lien

Agrandir la première fenêtre dans laquelle vous allez travailler.

Comme précédemment choisissez la molécule à afficher : Myosine 1

La myosine est réduite à sa tête et à deux chaînes légères qui entourent sa base. Elle est présentée dans un état 1 (liaison à l'actine). Choisir une représentation en sphère et une coloration par chaînes.

Une fois la représentation obtenue réduire la fenêtre :

Agrandir maintenant la deuxième fenêtre dans laquelle vous allez travailler.

Comme précédemment choisissez la molécule à afficher : Myosine 2

La myosine est réduite à sa tête et à deux chaînes légères qui entourent sa base. Elle est présentée dans un état 2 (détachée de l'actine).

Choisir une représentation en sphère et une coloration par chaînes.

Une fois la représentation obtenue réduire la fenêtre comme vous l'avez déjà fait.

Vous pouvez maintenant manipuler les deux molécules de manière à les disposer pour pouvoir les comparer facilement.

Pour information :

Clic gauche : rotation

Clic droit : translation

Molette : zoom

Fiche technique Libmol à télécharger : lien